「電子申告」画面にて「e-Taxソフト用ファイルを出力する」及び「PCdesk用ファイルを出力する」ボタンを押すと出力される電子申告用ファイルにつきましては、ファイルを開かずにそのまま「e-Tax」及び「eLTAX」システムに組み込んでください。
電子申告用の各ソフトに組み込むためのファイルですので、ファイルが開けないというのは問題ありません。
e-Taxへの組み込みにつきましては、次のマニュアルを参照ください。

全力法人税のデータをe-Taxソフトを使って電子申告をする方法
全力法人税で作成した法人税の確定申告書と消費税の確定申告書(修正申告含む)を、印刷して窓口や郵送で提出するのではなく、インターネットを通じて電子申告により提出する方法を解説します。国税の電子申告は、e-Tax(イータックス)というシステムを...
eLTAXへの組み込みにつきましては、次のマニュアルを参照ください。

全力法人税のデータを使ってeLTAXで電子申告をする方法
全力法人税で作成した地方税の確定申告書を、印刷して窓口や郵送で提出するのではなく、電子申告により提出する方法を解説します。電子申告をどのような方法でするかというと、全力法人税で作成した地方税の申告書データをPCdesk(ダウンロード版)とい...

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